球根鸢尾根腐病严重危害球根，使地下根系减少或根本不生根。受害轻的植株低矮而呈弯曲状，由根冠发病，组织变黑褐色，被覆孢子团。与受镰孢属菌侵染不同，染根腐病的植株不向内收缩，所以健康植株与受害植株外观不易分辨。此病不易传播，不会长期污染土壤。

疣孢青霉孢子通过侵染球根的微小伤口而使植株染病，受害处多为生根的根冠。

（1）用四氯丹及免赖得消毒种球。

（2）土壤消毒，或在种植后发病初期每平方米用依得利5-8克或普拔克7-14毫升消毒。

（3）用溴化甲烷消毒处理。

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